Sedat Peker, 15 Temmuz ana davası olan Akıncılar Üssü İddianamesinde yer alan edinilen bilgilere göre darbe girişiminin başarılı olması halinde FETÖ'cülerin ilk imha edeceği 26 kişilik listenin içerisinde yer alıyordu. Peker, konuyla alakalı olarak internet sitesi üzerinden yayınladığı video ile Ergenekon-Balyoz gibi davalarda mağdur olup, referandum için hayır çağrısı yapan bazı isimler için ağır eleştirilerde bulundu.
Yayınladığı videoda Peker, şu örneği verdi:'Cezaevinde üst hücremde vefat eden Muzaffer Abinin inlemelerini, eğer bir gün imkan olursa onların bütün hepsine yaşatma isteğiyle gerekirse ömrümün sonuna kadar bekleyeceğim.'